Los
SDN´s, al contrario que los Sistemas de depuración convencionales,
realizan el proceso de depuración del agua sin ningún aporte de energía
externa. Los SDN´s están concebidos para emular los mecanismos propios
de depuración de la naturaleza, para que la propia energía del
ecosistema, a través del viento, la radiación solar ó el metabolismo
bacteriano, realizen la depuración de las aguas residuales. 
Integración paisajística
Otra
de las grandes ventajas de los SDN´s son las relativas a la integración
paisajística del sistema, pudiéndose tener una depuradora perfectamente
trabajando, cuando ante nuestros ojos lo que se presenta es un
exuberante jardín. Los SDN´s son la Mejor Tecnología Disponible (MTD)
para lugares, como los espacios naturales protegidos ó lugares con
valores paisajísticos, naturales o etnográficos, donde se hace casi
obligatoria una integración de los sistemas de depuración en el medio.
Simplicidad de mantenimiento y explotación
Los
SDN´s al carecer de aparatos mecánicos y eléctricos, tienen una muy
baja probabilidad de dejar de funcionar. Así mismo, las labores de
mantenimiento y explotación, se reducen símplemente a la periódica
retirada de los fangos, así como a la labores de poda de la vegetación
de los humedales (sólo en el caso de que disponga de vegetación).
Garantía de funcionamiento eficaz frente a grandes oscilaciones de caudal y carga contaminante
Otras
de las ventajas de los SDN´s es la relativa a su resiliencia, entendida
como la capacidad del sistema para amortiguar los aumentos punta de
caudal y carga contaminante. Esta cualidad es propia de los sistemas
naturales de depuración que presentan mecanismos de respuesta rápida
frente a variaciones brucas de caudal y carga contaminante.